孤胆枪手2的隐藏点分布在各个关卡中，玩家需要仔细探索才能发现这些隐藏区域。第一关的隐藏点在刚打开大门的控制室后面，这里藏着初始资金。第二关与将军对话后，中间的门会打开，左面是商店，右面箱子里有物品。第三关同样在商店对面的箱子里有物资，这里有个分支选择：立即完成门口士兵的支线任务会获得晶体，而延迟到下一关完成则能得到价值5000多元的手枪。第五关开车清完怪后，经常会出现约143个怪物找不到的情况，这时需要到一号停车点附近走动，怪物会从任务点两侧的洞口刷新。
第六关建议购买夜视仪和照明灯交替使用，在第9个隐藏点内靠左墙行走还能发现一个隐藏房间，里面有三幅画像。第十二关第四个隐藏点附近还有一个隐蔽区域，靠墙右拐可以进入一个有6000元的房间。最后一关在对抗贝壳将军的场景左侧有个洞口，进入后会离开主地图，沿途需注意雷达显示，走一段会发现四个发生器，全部摧毁后继续前进会到达总BOSS地图，但要保持距离避免提前激活怪物。往上走到地图左侧还能发现另外八个隐藏的发生器。
隐藏点的探索需要结合环境观察和道具使用。部分隐藏区域需要特定操作才能触发，比如第五关必须驾车或步行到指定位置才会刷出剩余怪物。某些隐藏房间的入口设计十分隐蔽，往往需要贴着墙壁移动才能发现，例如第十二关的拐角处入口。雷达在寻找隐藏点时是重要工具，特别是在黑暗区域或复杂地形中，能帮助玩家定位那些视觉上难以发现的通道和物品。
游戏中的隐藏点奖励包括金钱、武器、弹药和特殊物品。虽然部分隐藏武器性能一般可以直接出售，但积累的金钱对购买高级装备至关重要。某些关卡隐藏点之间存在关联性，比如第三关的选择会影响后续隐藏奖励类型。部分隐藏区域如第六关的画像房间没有实际物资，主要提供环境叙事元素，这类设计增加了探索的多样性。
探索时建议采用系统性的方法：每个新区域先沿边缘搜索，注意墙面纹理变化和可疑角落；遇到分支任务时考虑不同选择对后续隐藏内容的影响；在车辆关卡要充分利用移动优势覆盖更大搜索范围。某些特殊怪物如胖头怪可以利用环境卡位，比如第二关右上角的花盆就是理想的卡点位置。这种战术既能保证安全探索隐藏点，又能有效应对突发战斗。
隐藏点的设计体现了游戏关卡制作的精细度，虽然部分区域需要反复尝试才能发现，但合理的探索路线规划能提高效率。建议在关键决策点如第三关任务选择前进行存档，以便体验不同的隐藏内容。游戏后期隐藏点的位置越来越隐蔽，往往需要结合多周目游玩才能完全发掘，这种设计延长了游戏的可探索性，也为玩家提供了持续挑战的动力。
