进入迷失岛二周目金字塔的关键在于触发火箭升空事件。当火箭启动后，原本有小狗的位置会变为金字塔入口。需将之前获得的蓝色宝石放置在金字塔门上，门上的凹槽形状与宝石完全吻合，放置后石门会自动开启。进入金字塔内部后，走廊中的红色柱子是第一个解谜点，互动后会显示章鱼图案，需记录其眼睛排列顺序。
返回工厂区域，观察被束缚的章鱼眼睛位置，并与红色柱子上的图案对照。按照章鱼眼睛的亮暗顺序点亮柱子上的对应符号，即可解开第一个谜题。随后走廊会出现华容道小游戏，需将红色方块移至右侧出口。解谜成功后继续深入，会遇见一名NPC并进入装有木乃伊的盒子区域，盒面图案与后续解谜密切相关。
盒子上数字5旁标记的y符号缺少一个点，这是重要提示。右手边墙壁暗藏第二个线索，而神庙二层的雕像右下角可找到数字3的对应符号。集齐所有线索后，需按照特定顺序调整盒子上的机关。成功解开后盒子会开启，获得关键道具。
最后阶段需破解金字塔密室的华容道谜题。观察方块布局，优先移动左下方大横块以腾出空间，随后逐步调整竖块位置，最终将红色方块推出。此步骤需耐心尝试，若卡关可参考具体移动顺序：左移下方横块、下移右侧竖块、右移上方横块、上移红色块前的竖块，重复操作直至通关。密室开启后与NPC对话即可完成二周目金字塔的核心流程。
整个过程中需注意三角碎片的收集，共六块分别位于灯塔桥梁、工厂章鱼旁、神庙壁虎上方、船舱左下角、金字塔石碑及神庙神像处。碎片用于开启神庙二楼密室，而密室内的章鱼壁画是工厂铁盒解谜的关键。铁盒开启后获得的铁锥需放置于激光装置上，配合NPC提供的密码4325调整钢管长度，最终激活时空门完成剧情。
金字塔内部谜题环环相扣，建议随身携带笔记工具记录图案和数字线索。若中途遗漏道具，需回溯工厂或神庙区域补全。二周目解谜逻辑与一周目存在递进关系，部分谜题需结合前次通关经验才能高效破解。
